Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp13Q5BKP2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp13Q5BKP2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp13Q5BKP2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp13Q5BKP2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms