Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trappc3lQ4KL14 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc3lQ4KL14 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trappc3lQ4KL14 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trappc3lQ4KL14 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trappc3lQ4KL14 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms