Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Krt35Q497I4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Krt35Q497I4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt35Q497I4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt35Q497I4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms