Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G9

1810049J17Rik, RIKEN cDNA 1810049J17 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810049J17RikQ3V2G9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
1810049J17RikQ3V2G9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
1810049J17RikQ3V2G9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
1810049J17RikQ3V2G9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms