Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D3

Ampd1, AMP deaminase 1, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd1Q3V1D3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ampd1Q3V1D3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ampd1Q3V1D3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ampd1Q3V1D3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ampd1Q3V1D3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ampd1Q3V1D3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ampd1Q3V1D3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ampd1Q3V1D3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms