Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim80Q3V061 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim80Q3V061 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trim80Q3V061 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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