Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc160Q3UYG1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc160Q3UYG1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc160Q3UYG1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc160Q3UYG1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms