Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
B230104I21RikQ3USW4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
B230104I21RikQ3USW4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
B230104I21RikQ3USW4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
B230104I21RikQ3USW4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms