Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mindy4Q3UQI9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mindy4Q3UQI9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mindy4Q3UQI9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mindy4Q3UQI9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms