Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hdgfl2Q3UMU9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hdgfl2Q3UMU9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Hdgfl2Q3UMU9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdgfl2Q3UMU9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdgfl2Q3UMU9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdgfl2Q3UMU9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdgfl2Q3UMU9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hdgfl2Q3UMU9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms