Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULJ3

Upf3a, MCG3697, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3aQ3ULJ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Upf3aQ3ULJ3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Upf3aQ3ULJ3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Upf3aQ3ULJ3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms