Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ell2Q3UKU1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ell2Q3UKU1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ell2Q3UKU1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ell2Q3UKU1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ell2Q3UKU1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms