Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tmem109Q3UBX0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmem109Q3UBX0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmem109Q3UBX0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem109Q3UBX0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms