Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssbp4Q3U4B1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssbp4Q3U4B1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ssbp4Q3U4B1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms