Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Kdm4dQ3U2K5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kdm4dQ3U2K5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kdm4dQ3U2K5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms