Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Vars2Q3U2A8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Vars2Q3U2A8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Vars2Q3U2A8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Vars2Q3U2A8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms