Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Serac1Q3U213 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Serac1Q3U213 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Serac1Q3U213 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Serac1Q3U213 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms