Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc38a5Q3U1J0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc38a5Q3U1J0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc38a5Q3U1J0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms