Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc174Q3U155 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc174Q3U155 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc174Q3U155 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc174Q3U155 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms