Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Tbc1d2bQ3U0J8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tbc1d2bQ3U0J8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbc1d2bQ3U0J8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbc1d2bQ3U0J8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms