Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TchpQ3TVW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TchpQ3TVW5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TchpQ3TVW5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms