Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccndbp1Q3TVC7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccndbp1Q3TVC7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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