Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Tamm41Q3TUH1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Tamm41Q3TUH1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tamm41Q3TUH1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms