Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q3TTJ4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q3TTJ4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Q3TTJ4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTJ4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTJ4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTJ4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTJ4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTJ4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTJ4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTJ4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3TTJ4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms