Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc102aQ3TMW1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ccdc102aQ3TMW1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms