Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2afvQ3THW5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2afvQ3THW5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
H2afvQ3THW5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H2afvQ3THW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms