Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prr27Q3SYJ2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prr27Q3SYJ2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prr27Q3SYJ2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms