Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
H2-M3Q31093 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
H2-M3Q31093 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
H2-M3Q31093 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms