Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col24a1Q30D77 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col24a1Q30D77 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col24a1Q30D77 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Col24a1Q30D77 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.3 ms