Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpne9Q1RLL3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cpne9Q1RLL3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cpne9Q1RLL3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms