Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rpusd2Q149F1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rpusd2Q149F1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpusd2Q149F1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpusd2Q149F1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpusd2Q149F1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpusd2Q149F1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpusd2Q149F1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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