Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kndc1Q0KK55 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kndc1Q0KK55 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kndc1Q0KK55 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kndc1Q0KK55 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kndc1Q0KK55 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Kndc1Q0KK55 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kndc1Q0KK55 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kndc1Q0KK55 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kndc1Q0KK55 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms