Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Znf541Q0GGX2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Znf541Q0GGX2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Znf541Q0GGX2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Znf541Q0GGX2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms