Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q08AU9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q08AU9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q08AU9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q08AU9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q08AU9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q08AU9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q08AU9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q08AU9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q08AU9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q08AU9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q08AU9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q08AU9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q08AU9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q08AU9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q08AU9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q08AU9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q08AU9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q08AU9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q08AU9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q08AU9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q08AU9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q08AU9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q08AU9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q08AU9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q08AU9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Q08AU9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q08AU9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q08AU9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q08AU9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q08AU9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q08AU9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q08AU9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q08AU9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q08AU9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q08AU9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q08AU9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q08AU9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q08AU9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q08AU9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q08AU9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q08AU9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q08AU9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q08AU9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q08AU9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q08AU9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q08AU9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q08AU9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q08AU9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q08AU9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q08AU9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q08AU9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q08AU9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q08AU9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q08AU9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q08AU9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q08AU9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q08AU9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q08AU9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q08AU9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q08AU9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q08AU9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q08AU9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q08AU9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q08AU9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q08AU9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q08AU9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q08AU9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q08AU9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q08AU9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q08AU9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q08AU9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q08AU9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q08AU9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q08AU9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q08AU9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q08AU9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms