Protein–RNA interactions for Protein: Q08879

Fbln1, Fibulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbln1Q08879 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Fbln1Q08879 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbln1Q08879 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbln1Q08879 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms