Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc4Q08624 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxc4Q08624 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxc4Q08624 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms