Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NrepQ07475 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NrepQ07475 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NrepQ07475 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms