Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AmbpQ07456 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AmbpQ07456 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AmbpQ07456 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
AmbpQ07456 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms