Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Thbs3Q05895 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Thbs3Q05895 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Thbs3Q05895 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms