Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Emx2Q04744 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Emx2Q04744 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Emx2Q04744 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms