Protein–RNA interactions for Protein: Q04735

Cdk16, Cyclin-dependent kinase 16, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk16Q04735 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cdk16Q04735 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk16Q04735 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk16Q04735 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cdk16Q04735 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms