Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cxcr5Q04683 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cxcr5Q04683 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cxcr5Q04683 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms