Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Msx2Q03358 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Msx2Q03358 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Msx2Q03358 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms