Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Runx1Q03347 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Runx1Q03347 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Runx1Q03347 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms