Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nhlh1Q02576 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nhlh1Q02576 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nhlh1Q02576 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nhlh1Q02576 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms