Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ly9Q01965 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly9Q01965 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ly9Q01965 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ly9Q01965 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms