Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cacna1cQ01815 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cacna1cQ01815 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms