Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VegfaQ00731 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VegfaQ00731 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VegfaQ00731 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VegfaQ00731 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms