Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd80Q00609 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd80Q00609 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd80Q00609 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cd80Q00609 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd80Q00609 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd80Q00609 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd80Q00609 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd80Q00609 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd80Q00609 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cd80Q00609 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd80Q00609 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd80Q00609 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd80Q00609 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd80Q00609 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd80Q00609 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cd80Q00609 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd80Q00609 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd80Q00609 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd80Q00609 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd80Q00609 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd80Q00609 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd80Q00609 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd80Q00609 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd80Q00609 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd80Q00609 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd80Q00609 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd80Q00609 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd80Q00609 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd80Q00609 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms