Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GabpaQ00422 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GabpaQ00422 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GabpaQ00422 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GabpaQ00422 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms